Первая и важная ступень к химическим, биологическим и медицинским факультетам ведущих вузов страны – это выбор специального школьного класса. В Лицее ЧГУ созданы все условия для полноценной работы в этой области, есть возможность проводить различные эксперименты и опыты, есть основные и дополнительные занятия по химии, биологии и другим предметам. Особое внимание уделяется внеурочной деятельности по химии, в рамках которой ученики старших и младших классов вовлечены в активную исследовательскую деятельность, участвуют в научно-практических конференциях и в олимпиадном движении.